Ну и еще такой момент - там БП как правило нестандарные, так что если сгорит то могут быть проблемы...
Кстати в стандартный тауэр докупить или поменять блок питания на более мощный это дешевле чем менять весь корпус с блоком питания.
Chieftec Smart GPS-700A8 стоит 1700 гривен, а корпус для него еще от 1000 гривен (
http://hotline.ua/computer/korpusa/295165-1735/).
Если есть проблемы с местом и эстетикой, то ИМХО стоит заморачиваться, если нет - комп под стол, раз в месяц чистка от пыли всех дырок пылесосом и раз в квартал или полгода чистка всей пыли внутри. Ну или если корпус должен стоять на столе, а под стол его нельзя поставить. Кстати под столом компьютер слышно куда меньше.
Тут еще момент - чем больше корпус тем больше возможностей. Например, будет шумно - можно добавить водяное охлаждение или аккуратно обшить панели шумопоглотителем. Будет жарко - вкрутить пассивный радиатор или пару низко оборотистых кулеров на заднюю/переднюю стенку.
Иногда надо поставить DVD-ROM или по случаю прикупить диск, который легко докинуть внутрь корпуса.
Но опять же - все индивидуально для каждого.